根据八字学说，一个人的八字包含年、月、日、时四要素，每一个要素都对应了天干地支以及五行中的一行。
对于该名男宝宝（出生于2025年5月6日中午13点20分），我们先从八字推算出天干地支信息：
- 年：丁酉年，丁属火，酉属金。
- 月：己巳月，己属土，巳属火。
- 日：此信息缺失，需完整八字才能推算。
- 时：未时（13点至15点），未属土。
综合以上信息，我们可以得知该男宝宝命理中已经包含了火、金、土三种五行元素。但具体五行是否有所缺失，还需结合完整的八字信息才能准确判断。
五行平衡与缺失
在八字学说中，五行平衡是理想的状态，但每个人的八字中或多或少都会有所偏向或缺失。不过，即便有所缺失也不必过于担心，因为五行是相生相克的，缺一也可通过后天的环境和行为来调和与补足。准确判断五行是否缺失仍需专业的八字排盘来推算。
由于题目未提供完整的八字信息，无法确切地指出该男宝宝是否五行有所缺失。若要全面分析五行属性及可能的缺失情况，需要完整且准确的八字信息来进行推算。一般来说，水、木等五行元素也是常见的重要元素之一，在八字的组合中也需要均衡考虑。
综合分析与建议
虽然我们无法根据提供的信息确定五行是否有所缺失，但可以提供一些一般性的建议供家长参考：
1. 保持宝宝的生活环境与自然界的和谐，包括但不限于自然光线、绿化植物等，有助于宝宝的成长。
2. 注意宝宝饮食的平衡和多样化，不同的食物也有其特定的五行属性，合理搭配有助于五行的平衡。
3. 适时地让宝宝接触大自然和阳光，进行适当的户外活动也有助于五行的调和。