根据中国传统命理学，马年九月初一出生的人属于马年火象。而十点四十这个时间点，虽然未给出具体月份和年份，我们可以根据常识推断，这通常是在秋季的某个时刻。在五行中，秋季与金元素相联系。我们需结合时辰与年月来分析。
1. 金元素：金代表收敛、坚硬和珍贵，金的特性为敛实与收获。考虑到出生于秋季和早晨至中午之间的时间点，金元素通常为旺盛之时。具体是否缺金还需结合年月日的天干地支综合判断。
2. 木元素：木代表生长与生机。由于处于秋季和马年的特性（活泼），可能表明在命理中需要一些木元素来调和活跃的火性。但具体是否缺木，还需结合其他因素。
3. 水元素：水代表流动、智慧与变通。考虑到五行相生的原理（金生水，水克火），可能此时出生的个体在五行中会有些许水元素不足的迹象，因为火的旺盛可能抑制了水的流通。
4. 火元素：由于是马年且时辰处于日中的位置，火元素自然是旺盛的。火代表着热情与活力，但过旺则可能带来急躁或过于冲动的问题。
5. 土元素：土为稳定之基，代表着物质基础和稳定性。对于这一时辰出生的人而言，土的元素也十分重要，能平衡火过旺的问题。然而具体缺不缺土还需要具体日子的天干地支综合分析。
马年九月初一十点四十出生的人在五行中可能存在水或土元素的不足。真正的五行缺失与否及具体如何调和缺失元素需要依据年月日的具体天干地支来进行精确计算和分析。